协会秘书处下设办公室、综合业务部、研究咨询部、会员工作部、国防专利中心、中国军转民杂志社。协会下设系统工程软件产业分会。以各军工集团公司、民口配套单位和优势民营企业为骨干，拥有庞大的专家和会员队伍。

　　协会成立30多年来，举办国际和国内大型展览交易会和论坛30余次，完成政府和军队委托的研究课题百余项，承担支撑性专项工作10余项，举办各类培训班200余期，出版杂志近200期，完成专利代理6000余件。

新时期，协会将不忘初心，继续前进，努力打造成国际知名、国内一流、具有鲜明特色和影响力的社团组织。

　　协会宗旨、愿景、理念——跨军地、全国性、非营利性的社团组织

　　宗旨：遵守国家宪法、法律、法规和政策，遵守社会道德风尚。坚持军民结合、寓军于民方针，贯彻落实军民融合发展国家战略，促进军民技术双向转移，促进军民资源互动共享，促进军民融合深度发展，服务政府，服务军队，服务会员，服务社会。

　　愿景：努力将协会打造成国际知名、国内一流、具有鲜明特色和影响力的社团组织。

　　理念：立足军民融合 携手共创事业 服务创造价值

　　协会特色优势——联系广泛 立场客观 团队强大 资质完备 机制完善

　　一是联系广泛：协会与国家发改委、工信信部、科工局等政府有关部门、军委装发部、科技委有关部门、军工集团及其所属企事业单位、各省省工办、以及有关行业协会和和地方军民融合管理机构保持业务联系。

　　二是立场客观：没有行业的局限、没有部门利益关系、没有区域限制，脱钩之后，更加独立自主地全方位开展活动和提供服务。

　　三是团队强大：坚持小核心大协作的运行模式，协会内部机构独当一面、加加强配合，外部依托广泛的专家队伍和协作单位，确保每个工作项目的人才资源保证。

　　四是资质完备：具有咨询服务涉密资质和企业信评资质。

　　五是机制完善：作为社团法人，即具备体制内单位的规范性，又有企业经营的灵活性。人员招聘可根据协会业务发展和变化情况，及时调整人员结构和岗位设置。